= Soumission d'un job d'analyse athena/DQ2 avec pathena =
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Ce tutoriel décrit comment executer un job d'analyse en utilisant:
  
  * pathena
  * Le software d'ATLAS athena
  * Un package d'analyse à compiler (Merci à Annick Lleres).
  * Des fichiers de dataset obtenus avec DQ2.


Pour lancer un job, vous avez besoin d'un fichier

  * '''L'archive du package''' package.tgz contenant le package d'analyse à compiler.[[BR]]
  Le package fourni produit des DPD à partir d'AOD.

 == Prérequis ==
  * [wiki:setupAthenaLocal Préparer votre environnement] comme pour un job à lancer en local (cmthome, testarea...)
  * [wiki:setuppathena Installez et configurez l'outil de soumission de job pathena.]
  * Décompressez le package fourni sous testarea puis initialiser le (après l'avoir éventuellement compilé)
  
 {{{
sh-3.00$ gmake
}}}

 ==== Le fichier joboptions ====
 {{{
sh-3.00$ cd testarea/14.2.20/TopAnalysis/run/ 

}}}
 Placez vous dans le répertoire run. Vous devez y trouver les fichiers joboptions !RunTopAnalysisDPD.py et !TopAnalysisDPD.py [[BR]]
 Vous n'avez rien à modifier, pathena analyse vos job options automatiquement. 


 
 ==== Initialisation de l'environnement d'exécution dans pathena ==== 
{{{
sh-3.00$ ganga


}}}

  ==== Lancer le job ====
Pour lancer votre job vous devez taper une commande où vous précisez quelles données vous mettez en entrée et quelles données vous voulez récupérez en sortie.

 {{{
In 
}}}

  Cette ligne d'instruction mérite quelques explications : 
  
 ==== Suivre l'état d'avancement du job ====

  ==== Récuperer les données ====

Quand le statut du job est completed (i.e. tous les subjobs sont completed) vous pouvez récupérer le dataset crée avec dq2-get
 {{{
sh-3.00$ dq2-list-dataset "userFL*"
userFL08.FabianLambert.ganga.2.20081024
sh-3.00$ dq2-get userFL08.FabianLambert.ganga.2.20081024
Querying DQ2 central catalogues to resolve datasetname userFL08.FabianLambert.ganga.2.20081024
Datasets found: 1
userFL08.FabianLambert.ganga.2.20081024: Querying DQ2 central catalogues for replicas...
Querying DQ2 central catalogues for files in dataset...
userFL08.FabianLambert.ganga.2.20081024: Using site IN2P3-LPSC_USERDISK
userFL08.FabianLambert.ganga.2.20081024: Querying local file catalogue of site IN2P3-LPSC_USERDISK...
... 
}}}

[wiki:tutoganga up]