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Soumission d'une collection de jobs avec JJS
Démarrer la base de donnée de JJS
JJS fonctionne avec une base de donnée où il stocke des informations lui permettant de trouver automatiquement le meilleur site pour vos jobs.
Dans tous les cas vous devez démarrer ce serveur avant de soumettre des jobs
Notez que pour une première utilisation vous devez initialiser cette base de donnée.
Démarrer le serveur de base de donnée de JJS
cd %JJS_HOME/database >jjs-database-server
Initialiser la base de donnée (1ère utilisation)
cd %JJS_HOME/admin >jjs-resource-manager --update_all
Note : Attention, les fichiers de bases de donnée HSQL sont crées là où vous démarrer le serveur.
Sous Windows, créez vous un raccourci vers jjs-database-server.bat afin d'être sûr de bien démarrer le serveur de la même façon à chaque fois.
Créer un certificat proxy VOMS
Dans une nouvelle fenêtre de commande, taper la commande suivante. Vous devez entrer votre passphrase, puis le nom de votre VO.
>jjs-proxy-init VOMS Enter value for attribute 'UserPass' of security context instance 'VOMS[0]' Enter value for attribute 'UserVO' of security context instance 'VOMS[0]' atlas
Soumettre une collection de jobs
Cet exemple décrit comment soumettre une collection de jobs d'analyse athena.
Ces jobs vont produire des fichiers DPD à partir d'AOD et les stocker dans un dataset sur le SE du LPSC.
Création d'un template JDL
Le template est le fichier job.jdl.
Ouvrez ce fichier, il ressemble beaucoup à un JDL normal, sauf qu'il contient des expressions entre caractère #
JJS a un évaluateur d'expression qui vous permet de générer des JDL à partir d'un template de manière automatique.
Génération d'une collection de JDL à partir du template
Vous devez taper la commande jjs-create-jdl , elle va vous générer 6 fichier JDL que vous trouverez en attachement.
> cd myDirectory > jjs-create-jdl -t job.jdl -o . -i . -n 6 --var1 6
- -t : fichier template à utiliser
- -o : output directory
- -i : input directory (là où se trouve les fichiers qui vont passer par la inputsandbox)
- -n : nombre de fichiers JDL à générer
- --var1 : La variable utilisée dans le template, elle correspond à l'indice des fichiers du dataset.
Attachments (9)
- job.jdl (586 bytes ) - added by 16 years ago.
- job1.jdl (570 bytes ) - added by 16 years ago.
- job2.jdl (570 bytes ) - added by 16 years ago.
- job3.jdl (570 bytes ) - added by 16 years ago.
- job4.jdl (570 bytes ) - added by 16 years ago.
- job5.jdl (570 bytes ) - added by 16 years ago.
- job6.jdl (570 bytes ) - added by 16 years ago.
- SingleTopDPDMaker.tgz (787.3 KB ) - added by 16 years ago.
- job.sh (2.9 KB ) - added by 16 years ago.
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