wiki:tutoGANGACmdLine

Version 4 (modified by /O=GRID-FR/C=FR/O=CNRS/OU=LPSC/CN=Fabian Lambert, 16 years ago) ( diff )

--

GANGA en mode ligne de commande

Ce tutoriel montre le principe de fonctionnement de GANGA. Le job exécuté est celui de l'exemple de soumission de job avec LCG2.

  • Lancement de GANGA

    L'exécutable GANGA se trouve sous $GANGA_INSTALL_DIR/install/X.Y.Z/bin où X.Y.Z est la version de GANGA.
    Pour plus de facilité, mettez à jour votre variable d'environnement $PATH avec le chemin vers l'executable. Pour lacer GANGA il suffit de taper la commande ganga.
    [lambert@lpsc-ui ~]$ ganga
    
    *** Welcome to Ganga ***
    Version: Ganga-5-0-4
    Documentation and support: http://cern.ch/ganga
    Type help() or help('index') for online help.
    
    This is free software (GPL), and you are welcome to redistribute it
    under certain conditions; type license() for details.
    
    
    ATLAS User Support is provided by the Hypernews Forum Ganga User and Developers
    You find the forum at https://hypernews.cern.ch/HyperNews/Atlas/get/GANGAUserDeveloper.html
    or you can send an email to hn-atlas-GANGAUserDeveloper@cern.ch
    
    GangaAtlas                         : INFO     Tasks read from file
    Ganga.GPIDev.Lib.JobRegistry       : INFO     Found 1 jobs in "jobs", completed in 0 seconds
    Ganga.GPIDev.Lib.JobRegistry       : INFO     Found 1 jobs in "templates", completed in 0 seconds
    
    
    In [1]:
    
    
    PS: Si il s'agit de votre première session, GANGA peut vous demander votre passphrase afin de créer un proxy VOMS à partir de votre certificat. Ce proxy sera utiliser par l'application lors de la soumission de job.
  • Définir un objet Job

    L'objet Job représente votre job, vous allez ensuite renseigner certains de ses attributs avant de le soumettre en utilisant ses fonctionnalités.
    Après le lancement de GANGA, vous obtenez un prompt, pour définir l'objet Job tapez la commande suivante.
    j=Job()
    
    j designe maintenant pour GANGA une instance d'un objet de type Job en mémoire.
  • Définir les paramètres du Job

    Notre job prend deux arguments en entrée. Nous l'indiquons à notre instance de job de la façon suivante :
    In [2]:j.application = Executable(exe = File('~/TestGrid/edg3/job.sh'), args=['girafe','flipflap'])
    

*Soumission de job

Pour soumettre le job, il faut utiliser la fonctionnalité submit de l'instance.

In [3]:j.submit()
Ganga.GPIDev.Lib.Job               : INFO     submitting job 18
Ganga.GPIDev.Adapters              : WARNING  file /atlas/lambert/TestGrid/edg3/job.sh is not executable, overriding executable permissions in the input sandbox
Ganga.GPIDev.Adapters              : INFO     submitting job 18 to Local backend
Ganga.GPIDev.Lib.Job               : INFO     job 18 status changed to "submitted"
Out[3]: 1

*Obtenir l'ID du job

Avec GANGA les jobs ont leur propre ID. Pour l'obtenir exécutez les commande suivante

In [4]:print j.id
18
Ganga.GPIDev.Lib.Job               : INFO     job 18 status changed to "running"
Ganga.GPIDev.Lib.Job               : INFO     job 18 status changed to "completed"

PS: En cas de changements de statut du job, les changements apparaissent quand vous appuyer sur la touche return.

*Obtenir une description complete du job

Rien de plus simple, tapez j (la variable qui représente l'instance du Job) :

In [5]:j
Out[5]: Job (
 status = 'completed' ,
 name = '' ,
 inputdir = '/atlas/lambert/gangadir/workspace/lambert/LocalAMGA/18/input/' ,
 outputdir = '/atlas/lambert/gangadir/workspace/lambert/LocalAMGA/18/output/' ,
 outputsandbox = [] ,
 id = 18 ,
 info = JobInfo (
    submit_counter = 1 
    ) ,
 inputdata = None ,
 merger = None ,
 inputsandbox = [] ,
 application = Executable (
    exe = File(name='/atlas/lambert/TestGrid/edg3/job.sh',subdir='.') ,
    env = {} ,
    args = ['girafe', 'flipflap'] 
    ) ,
 outputdata = None ,
 splitter = None ,
 subjobs = 'Job slice:  jobs(18).subjobs (0 jobs)
' ,
 backend = Local (
    actualCE = 'lpsc-ui.in2p3.fr' ,
    workdir = '/tmp/tmptrit10' ,
    id = 2126 ,
    exitcode = 0 
    ) 
 ) 

up

Attachments (2)

Download all attachments as: .zip

Note: See TracWiki for help on using the wiki.