Changes between Version 3 and Version 4 of setuppathena


Ignore:
Timestamp:
07/11/2008 14:34:59 (16 years ago)
Author:
/O=GRID-FR/C=FR/O=CNRS/OU=LPSC/CN=Fabian Lambert
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified

  • setuppathena

    v3 v4  
    4747}}}
    4848 
    49  
     49 == Obtenir de l'aide sur la commande pathena ==
     50  * Placez vous ensuite dans le repertoire run de votre package d'analyse. [[BR]] Vous pouvez obtenir de l'aide sur la commande pathena en tapant la commande suivante
     51  {{{
     52sh-3.00$ pathena --help
     53Usage: pathena [options] <jobOption1.py> [<jobOption2.py> [...]]
    5054
     55'pathena --help' prints a summary of the options
    5156
     57Options:
     58  -h, --help            show this help message and exit
     59  --split=SPLIT         Number of sub-jobs to which a job is split
     60  --nFilesPerJob=NFILESPERJOB
     61                        Number of files on which each sub-job runs
     62  --nEventsPerJob=NEVENTSPERJOB
     63                        Number of events on which each sub-job runs
     64  --nEventsPerFile=NEVENTSPERFILE
     65                        Number of events per file
     66  --site=SITE           Site name where jobs are sent
     67                        (default:ANALY_BNL_ATLAS_1
     68  --inDS=INDS           Name of an input dataset
     69  --minDS=MINDS         Dataset name for minimum bias stream
     70  --nMin=NMIN           Number of minimum bias files per one signal file
     71  --cavDS=CAVDS         Dataset name for cavern stream
     72  --nCav=NCAV           Number of cavern files per one signal file
     73  --libDS=LIBDS         Name of a library dataset
     74  --beamHaloADS=BEAMHALOADS
     75                        Dataset name for beam halo A-side
     76  --beamHaloCDS=BEAMHALOCDS
     77                        Dataset name for beam halo C-side
     78  --nBeamHaloA=NBEAMHALOA
     79                        Number of beam halo files for A-side per sub job
     80  --nBeamHaloC=NBEAMHALOC
     81                        Number of beam halo files for C-side per sub job
     82  --beamGasHDS=BEAMGASHDS
     83                        Dataset name for beam gas Hydrogen
     84  --beamGasCDS=BEAMGASCDS
     85                        Dataset name for beam gas Carbon
     86  --beamGasODS=BEAMGASODS
     87                        Dataset name for beam gas Oxygen
     88  --nBeamGasH=NBEAMGASH
     89                        Number of beam gas files for Hydrogen per sub job
     90  --nBeamGasC=NBEAMGASC
     91                        Number of beam gas files for Carbon per sub job
     92  --nBeamGasO=NBEAMGASO
     93                        Number of beam gas files for Oxygen per sub job
     94  --outDS=OUTDS         Name of an output dataset. OUTDS will contain all
     95                        output files
     96  --destSE=DESTSE       Destination strorage element. All outputs go to DESTSE
     97                        (default :%BNL_ATLAS_2)
     98  --nFiles=NFILES, --nfiles=NFILES
     99                        Use an limited number of files in the input dataset
     100  --nSkipFiles=NSKIPFILES
     101                        Skip N files in the input dataset
     102  -v                    Verbose
     103  -l, --long            Send job to a long queue
     104  --blong               Send build job to a long queue
     105  --cloud=CLOUD         cloud where jobs are submitted (default:US)
     106  --noBuild             Skip buildJob
     107  --individualOutDS     Create individual output dataset for each data-type.
     108                        By default, all output files are added to one output
     109                        dataset
     110  --noRandom            Enter random seeds manually
     111  --memory=MEMORY       Required memory size
     112  --official            Produce official dataset
     113  --extFile=EXTFILE     pathena exports files with some special extensions
     114                        (.C, .dat, .py .xml) in the current directory. If you
     115                        want to add other files, specify their names, e.g.,
     116                        data1,root,data2.doc
     117  --extOutFile=EXTOUTFILE
     118                        define extra output files, e.g.,
     119                        output1.txt,output2.dat
     120  --supStream=SUPSTREAM
     121                        suppress some output streams. e.g., ESD,TAG
     122  --noSubmit            Don't submit jobs
     123  --generalInput        Read input files with general format except
     124                        POOL,ROOT,ByteStream
     125  --tmpDir=TMPDIR       Temporary directory in which an archive file is
     126                        created
     127  --shipInput           Ship input files to remote WNs
     128  --noLock              Don't create a lock for local database access
     129  --fileList=FILELIST   List of files in the input dataset to be run
     130  --myproxy=MYPROXY     Name of the myproxy server
     131  --dbRelease=DBRELEASE
     132                        DBRelease or CDRelease (DatasetName:FileName). e.g., d
     133                        do.000001.Atlas.Ideal.DBRelease.v050101:DBRelease-5.1.
     134                        1.tar.gz
     135  --addPoolFC=ADDPOOLFC
     136                        file names to be inserted into PoolFileCatalog.xml
     137                        except input files. e.g., MyCalib1.root,MyGeom2.root
     138  --skipScan            Skip LRC/LFC lookup at job submission
     139  --inputFileList=INPUTFILELIST
     140                        name of file which contains a list of files to be run
     141                        in the input dataset
     142  --removeFileList=REMOVEFILELIST
     143                        name of file which contains a list of files to be
     144                        removed from the input dataset
     145  --corCheck            Enable a checker to skip corrupted files
     146  --prestage            EXPERIMENTAL : Enable prestager. Make sure that you
     147                        are authorized
     148  --novoms              don't use VOMS extensions
     149  --useNextEvent        Set this option if your jobO uses theApp.nextEvent()
     150                        e.g. for G4
     151  --ara                 use Athena ROOT Access
     152  --ares                use Athena ROOT Access + PyAthena, i.e., use athena.py
     153                        instead of python on WNs
     154  --araOutFile=ARAOUTFILE
     155                        define output files for ARA, e.g.,
     156                        output1.root,output2.root
     157  --trf=TRF             run transformation, e.g. --trf "csc_atlfast_trf.py %IN
     158                        %OUT.AOD.root %OUT.ntuple.root -1 0"
     159  --spaceToken=SPACETOKEN
     160                        spacetoken for outputs. e.g., ATLASLOCALGROUPDISK
     161  --notSkipMissing      If input files are not read from SE, they will be
     162                        skipped by default. This option disables the
     163                        functionality
     164  --burstSubmit=BURSTSUBMIT
     165                        Please don't use this option. Only for site validation
     166                        by experts
     167  --devSrv              Please don't use this option. Only for developers to
     168                        use the dev panda server
     169  --useAIDA             use AIDA
     170  --inputType=INPUTTYPE
     171                        File type in input dataset which contains multiple
     172                        file types
     173  --mcData=MCDATA       Create a symlink with linkName to .dat which is
     174                        contained in input file
     175  --pfnList=PFNLIST     Name of file which contains a list of input PFNs.
     176                        Those files can be un-registered in DDM
     177  --useExperimental     use experimental features
     178  -c COMMAND            One-liner, runs before any jobOs
     179  -p BOOTSTRAP          location of bootstrap file
     180
     181}}}
     182'
    52183[wiki:tutopathena up]