wiki:lcgTuto

Version 37 (modified by /O=GRID-FR/C=FR/O=CNRS/OU=LPSC/CN=Fabian Lambert, 16 years ago) ( diff )

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Manipulation de données grille

  • variable d'environnement
    Avant toutes choses, vous allez créer votre répertoire personnel sur le SE du LPSC. Pour cela il est nécessaire de définir les variables d'environnement $DPNS_HOST et $DPNS_HOME
    [lambert@lpsc-ui ~]$ setenv DPNS_HOST  lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr
    [lambert@lpsc-ui ~]$ setenv DPNS_HOME /dpm/in2p3.fr/home/atlas/
    
    Créez ensuite votre répertoire personnel
    [lambert@lpsc-ui ~]$ dpns-mkdir  flambert
    
    Il doit apparaitre maintenant sous /dpm/in2p3.fr/home/atlas
    [lambert@lpsc-ui ~]$ dpns-ls
    ...
    atlasmcdisk
    ...
    flambert
    ...
    

Remarque: Les commandes dpns-* sont par analogie assez similaires aux commandes lfc-*. Elles ne sont à utiliser que pour "préparer" le SE lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr

--> Exercice: Créez Egalement un repertoire test sous votre repertoire perso

  • Copie de fichier
    La copie d'un fichier local sur le SE se fait avec la commande lcg-cr (copy and register). Cette commande effectue la copie du fichier sur le SE et enregistre eventuellement un LFN dans le LFC.
    • lcg-cr [-l LFN] [-d SURL] srcFile
      [lambert@lpsc-ui ~/TestGrid]$ lcg-cr --vo atlas -l user.flambert.testfileLFN \
      -d srm://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr/dpm/in2p3.fr/home/atlas/flambert/user.flambert.testfile \
       file://atlas/lambert/TestGrid/user.flambert.testfile
      guid:67796c49-29ac-4831-838d-b5ffc389e846
      

La commande retourne un GUID qui identifie le fichier de manière unique sur la grille.

-->Exercice: Créez votre fichier et copiez le sur le SE dans votre répertoire.
-->Exercice: Vérifiez que le fichier à bien été enregistré dans le LFC.

  • Identifiants d'un fichier
    Une fois copier sur un SE et déclarer dans un LFC, un fichier peut être retrouvé avec plusieurs identifiants.
    • lcg-lg Obtenir le GUID à partir du LFN
      [lambert@lpsc-ui ~/TestGrid]$ lcg-lg lfn:user.flambert.testfileLFN
      guid:67796c49-29ac-4831-838d-b5ffc389e846  
      
    • lcg-la Obtenir le LFN à partir du GUID
      [lambert@lpsc-ui ~/TestGrid]$ lcg-la guid:67796c49-29ac-4831-838d-b5ffc389e846
      lfn:/grid/atlas/users/user.FabianLambert/user.flambert.testfileLFN
      
    • lcg-lr Obtenir la SURL à partir du LFN
      [lambert@lpsc-ui ~/TestGrid]$ lcg-lr lfn:user.flambert.testfileLFN
      srm://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr/dpm/in2p3.fr/home/atlas/flambert/user.flambert.testfile
      
    • lcg-gt Obtenir la TURL à partir de la SURL
      [lambert@lpsc-ui ~/TestGrid]$ lcg-gt srm://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr/dpm/in2p3.fr/home/atlas/flambert/user.flambert.testfile gsiftp
      gsiftp://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr/lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr:/data2/atlas/2008-05-22/user.flambert.testfile.89643.0
      89650
      0
      

--> Exercice : Testez les commandes précédentes sur votre fichier en essayant plusieurs options

  • Récupérer un fichier
    Un fichier copié sur un SE peut être récupéré en local.
    • lcg-cp srcFile destFile
      [lambert@lpsc-ui ~/TestGrid]$ lcg-cp --vo atlas lfn:user.flambert.testfileLFN file://atlas/lambert/TestGrid/user.flambert.testfileRecup
      [lambert@lpsc-ui ~/TestGrid]$ ls
      user.flambert.testfile   user.flambert.testfileRecup
      

--> Exercice : Récuperez votre fichier en local depuis le SE en utilisant successivement un GUID, une SURL, une TURL

  • Répliquer un fichier
    Un fichier peut-être répliquer d'un SE à un autre SE.
    Remarque : Dans l'exemple suivant le SE de destination est le même que le SE source, ceci afin d'éviter des problèmes de droits sur les fichiers.
    • lcg-rep [-d destFile] srcFile
      [lambert@lpsc-ui ~]$ lcg-rep --vo atlas -d srm://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr/dpm/in2p3.fr/home/atlas/flambert/testdir/user.flambert.testfileReplica lfn:user.flambert.testfileLFN
      [lambert@lpsc-ui ~]$ dpns-ls testdir
      user.flambert.testfileReplica
      

Le fichier a été répliqué sur le SE.

[lambert@lpsc-ui ~]$ lfc-ls testdir

Aucun alias (LFN) n'a été crée pour ce nouveau fichier...

[lambert@lpsc-ui ~]$ lcg-lr  lfn:user.flambert.testfileLFN
srm://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr/dpm/in2p3.fr/home/atlas/flambert/testdir/user.flambert.testfileReplica
srm://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr/dpm/in2p3.fr/home/atlas/flambert/user.flambert.testfile

... par contre l'alias pointe maintenant sur deux réplications du fichier. up ; previous

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