wiki:gliteWMS5

Version 13 (modified by /O=GRID-FR/C=FR/O=CNRS/OU=LPSC/CN=Fabian Lambert, 16 years ago) ( diff )

--

Analyse d'un job avec accès à un SE distant

Ce tutoriel décrit comment exécuter un job sur le CE du LPSC en utilisant des données sur un SE distant.

Pour lancer un job, vous avez besoin de deux fichiers

  • Le fichier JDL (Job Description Langage) Le fichier job.jdl est le fichier qui décrit votre job. Dans ce fichier vous trouverez une ligne de commentaire (#...) qui décrit chaque nouvelle instruction du fichier JDL.
  • L'executable Le fichier job.sh est le script qui va être exécuter sur la machine distante (le WN)
  • Utiliser un dataset
    Le dataset utilisé est valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25.
    Notez les guid des deux premiers fichiers qu'il contient
     [lambert@lpsc-ui JDL_InputSandBox_remote_gsiftp]$ dq2-list-files valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25
    ...
    BS.021085._00013.data.1         c3e3acf3-0728-4e5a-b9f3-9bc71fc938eb    md5:d34db6104ff44d7475d5f1957f57e89e    576129736
    ...
    

--> Exercice: Trouvez ce dataset avec AMI et cherchez à quelle type de données il correspond

  • Trouver les TURL des fichiers
    [lambert@lpsc-ui JDL_InputSandBox_remote_gsiftp]$ lcg-lr guid:c3e3acf3-0728-4e5a-b9f3-9bc71fc938eb
    srm://ccsrm.in2p3.fr/pnfs/in2p3.fr/data/atlas/atlasmcdisk/valid1/BS/valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25_tid021085/BS.021085._00013.data.1
    
    [lambert@lpsc-ui JDL_InputSandBox_remote_gsiftp]$ lcg-gt srm://ccsrm.in2p3.fr/pnfs/in2p3.fr/data/atlas/atlasmcdisk/valid1/BS/\
    valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25_tid021085/BS.021085._00013.data.1 gsiftp
    gsiftp://ccxfer13.in2p3.fr:2811//pnfs/in2p3.fr/data/atlas/atlasmcdisk/valid1/BS/valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25_tid021085/BS.021085._00013.data.1
    

-->Exercice: Ouvrez et analysez le fichiers job.jdl. Essayer de le modifier pour utiliser deux autres fichiers de votre choix.

  • Soumission du job et résultat
    [lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ glite-wms-job-submit -a job.jdl
    
    Connecting to the service https://wms105.cern.ch:7443/glite_wms_wmproxy_server
    
    
    ====================== glite-wms-job-submit Success ======================
    
    The job has been successfully submitted to the WMProxy
    Your job identifier is:
    
    https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
    
    ==========================================================================
    
    [lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ glite-wms-job-status https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
    
    
    *************************************************************
    BOOKKEEPING INFORMATION:
    
    Status info for the Job : https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
    Current Status:     Done (Success)
    Logged Reason(s):
        - 
        - Job terminated successfully
    Exit code:          0
    Status Reason:      Job terminated successfully
    Destination:        lpsc-ce.in2p3.fr:2119/jobmanager-pbs-atlas
    Submitted:          Tue May 27 17:04:50 2008 CEST
    *************************************************************
    
    [lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ glite-wms-job-output  https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
    
    Connecting to the service https://wms105.cern.ch:7443/glite_wms_wmproxy_server
    
    
    ================================================================================
    
                            JOB GET OUTPUT OUTCOME
    
    Output sandbox files for the job:
    https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
    have been successfully retrieved and stored in the directory:
    /tmp/lambert_DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
    
    ================================================================================
    
    [lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ cat /tmp/lambert_DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA/std.out
    Fichier:
    BS.021085._00013.data.1
    Liste des fichiers sur le WN:
    BS.021085._00013.data.1
    https_3a_2f_2flb105.cern.ch_3a9000_2fDLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA.output
    job.sh
    std.err
    std.out
    tmp.IgNVS14151
    

--> Exercice : Vérifiez que les fichiers de données ont bien été rapatriés sur le WN
--> Exercice : Quels autres fichiers trouvez vous sur le WN ? Cela correspond il aux instructions votre job.jdl et votre job.sh ?

up ; previous ; next

Attachments (2)

  • job.jdl (720 bytes ) - added by /O=GRID-FR/C=FR/O=CNRS/OU=LPSC/CN=Fabian Lambert 16 years ago. glite_wms_jdl_5
  • job.sh (231 bytes ) - added by /O=GRID-FR/C=FR/O=CNRS/OU=LPSC/CN=Fabian Lambert 16 years ago. glite_wms_job_5

Download all attachments as: .zip

Note: See TracWiki for help on using the wiki.