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Manipulation de fichier avec aliensh
Configurer l'environnement ALICE
Pour pouvoir avoir accès aux commandes alien, vous devez configurer votre environnement ALICE
Lancer une fenêtre de shell aliensh
sh-3.00$ aliensh [ aliensh 2.1.18 (C) ARDA/Alice: Andreas.Joachim.Peters@cern.ch/Derek.Feichtinger@cern.ch] aliensh:[alice] [1] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >
Aliensh est un environnement virtuel qui ressemble beaucoup à un shell usuel. Tout se passe comme si vous étiez connecté à une autre machine.
Par la suite, je parlerais d'environnement Grid pour désigner aliensh et d'environnement Local pour désigner la machine d'où vous vous êtes connecté (généralement une UI).
La variable alien_CLOSE_SE == (note: à vérifier)
alien est un shell qui vous présente les données de la grille comme si elles se trouvaient sur un disque local. En réalité, toutes les données que vous manipulez par l'intermédiaire d'un compte 'alien' sont stockées sur un SE de la grille.
Si vous ne précisez pas explicitement lequel, les commandes alien de manipulation de données prennent par défaut le SE définit par la variable alien_CLOSE_SE
aliensh:[alice] [2] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >echo $alien_CLOSE_SE ALICE::Grenoble::DPM
Les commandes du shell aliensh
Vous pouvez trouver une explication détaillée des commandes disponibles dans le user guide aliensh.
Commandes utiles
ls : Liste des fichiers sous environnement alien
aliensh:[alice] [1] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >ls .FILES_TO_COPY alien-tests bin FILES_TO_COPY Tutorial
cp : copie de fichier
- Local -> Grid
Dans l'exemple ci dessous, le fichier est copié du compte local sur le SE défini par défaut.
aliensh:[alice] [15] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >cp file:/atlas/lambert/test.xml alien:test.xml [xrootd] Total 0.00 MB |====================| 100.00 % [0.8 MB/s] aliensh:[alice] [21] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >ls test.xmlPour copier le fichier sur la grille sur un autre SE que celui par défaut, il faut préciser le SE
aliensh:[alice] [20] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >cp file:/atlas/lambert/test.xml alien:test2.xml@ALICE::CERN::SE [xrootd] Total 0.00 MB |====================| 100.00 % [4.9 MB/s] aliensh:[alice] [21] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >ls test.xml test2.xml
- Grid-> Local
whereis : trouver un fichier
aliensh:[alice] [17] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >whereis test.xml Oct 20 09:42:04 info The file test.xml is in SE => ALICE::Grenoble::DPM pfn =>root://lpsc-se-dpm-server.in2p3.fr:1094//dpm/in2p3.fr/home/alice/04/65235/d25571d8-bd4a-11de-8f1f-001e0b4e0440 aliensh:[alice] [22] /alice/cern.ch/user/f/flambert/ >whereis test2.xml Oct 20 09:52:18 info The file test2.xml is in SE => ALICE::CERN::SE pfn =>root://pcaliense04.cern.ch:1095//04/18702/0f2880bc-bd4d-11de-8271-001e0b4e0440
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